Caracterização molecular de bactérias do gênero Sphingomonas

Resumo

Estudos sobre a fixação biológica de nitrogênio em microrganismos têm ganho cada vez mais destaque em importantes leguminosas e outras culturas anuais. Pesquisadores descobriram que bactérias diazotróficas do gênero Sphingomonas têm sido encontradas em plantas, sobretudo da família Poaceae. Sphingomonas são bactérias de vida livre encontradas em ambientes naturais e antropogênicos, potenciais para o crescimento e desenvolvimento de plantas, uma vez que algumas delas possuem a capacidade de fixar nitrogênio atmosférico e promovem o crescimento de plantas. Existe um grande interesse em caracterizar a diversidade destes microrganismos; atualmente, os estudos da taxonomia moderna tem buscado a caracterização molecular e por métodos genotípicos. As bactérias do estudo haviam sido previamente isoladas de arroz (Oryza sativa) e arroz silvestre (Oryza glumaepatula) e encontram-se depositadas no Centro de Recursos Biológicos Johanna Döbereiner Embrapa Agrobiologia. Estudos preliminares mostraram que estas estirpes pertenciam ao gênero Sphingomonas. Alguns primers descritos na literatura foram testados em diversas condições de PCR para a realização de amplificações dos genes das estirpes. Primers específicos para os genes “housekeeping” (genes que desempenham funções especificas dentro da célula a partir da sintetização de proteínas) atpD, rpoB e gyrB foram testados. Os resultados obtidos até o momento indicam quatro grupos bacterianos, possivelmente 3 novas espécies, estando estas próximas das estirpes tipo de S. azotifigens NBRC 15495 e S. trueperi NBRC 16157. O gene nifH, de grande interesse por ser um dos responsáveis pela síntese da nitrogenase foi amplificado para quatro estirpes, comprovando que algumas bactérias do gênero Sphingomonas podem realizar a FBN. Este resultado também foi confirmado pela análise de redução de acetileno. No conjunto das análises observou-se que dentro das possíveis novas espécies existem tanto estirpes com habilidade em fixar N, quanto outras que não são fixadoras.