Seqüenciamento da região 16S rDNA de microrganismo da coleção de cultura Embrapa Agrobiologia

Resumo

As coleções de cultura de microrganismos ex-situ são importantes, pois preservam o material biológico no tempo e permitem estudos sobre a utilização da biodiversidade para fins biotecnológicos. No início as identificações das bactérias eram feitas apenas principalmente por análises morfológicas e fisiológicas comparada a padrões de espécies conhecidas sendo ao final feita a caracterização molecular pela técnica de homologia do DNA total. Com o avanço e inovações de técnicas moleculares baseadas em extração de DNA genômico e análises de sequencia de genes ribossomais como o 16S rRNA (rDNA), as avaliações genotípicas complementaram  as avaliações fenotípicas, sendo hoje descrita a avaliação como “Taxonomia Polimórfica”. Este processo analítico contribui para gerar informações substanciais quanto às relações ecológicas e evolucionárias, além da identificação do microrganismo. Ao passar dos anos esta classificação permitiu a descrição de novas espécies de bactérias diazotróficas depositadas na nossa coleção como a Burkholderia silvatlantica e o Azospirillum doebereinerae entre outros; mas também aumentou a complexidade de gêneros como o Azospirillum, que hoje compreende 15 espécies descritas. O presente plano de trabalho tem como objetivo avaliar geneticamente as bactérias diazotróficas depositadas na Coleção de Microrganismos Multifuncionais da EMBRAPA e que foram parcialmente avaliados com base em inúmeros testes morfológicos. Será utilizado o seqüenciamento parcial ou total do gene 16S (rDNA), para comparações de sequencias em bancos de dados que permitem determinar o posicionamento taxonômico das bactérias da coleção. Ao final de dois anos o grupo pretende apresentar novas metodologias de caracterização e ou utilização deste acervo microbiano institucional.